生态与环境科学方向
利用微生物实验室和理化分析技术，监测农田中的土壤养分和污染物。提供生态环境评价和优化建议，支持可持续农业实践。开发农业废弃物（如秸秆、果皮）的资源化利用技术，如生物燃料、饲料添加剂。利用微生物技术进行农业废弃物的快速分解和堆肥处理。研发可降解农膜、绿色农药和环保肥料。分析新型农业投入品对环境和作物的影响。
微生物技术与生物资源方向
分离和鉴定植物或动物病原菌，研究病害的传播机制。开发微生物防治策略，替代传统农药。挖掘有益微生物资源，如固氮菌、促生菌，用于生态农业。开发高效工业微生物，用于发酵产品的生产。研究土壤微生物群落对植物生长的影响，优化土壤微生态平衡。利用微生物技术进行土壤或水体修复，减少环境污染。